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数码世界，在经历了数次重构以及毁灭复苏，其存在形态已经与最初的原始时期产生了极大的不同。
相应的，存在于数码世界内部的数码兽们，也遭受了一系列的生死危机，神明抛弃了他们，拒绝对其伸出援手，并派出其麾下强大的骑士施以清洗，可是……
神明没有想到，作为世界的最高主宰，骑士们的领导者，最先败亡的反而是自己。
王和新任神明与骑士们在将所有的精力都放在了如何稳定数码世界的时候，在某个角落，一个受到负面数据所影响的无形灵魂诞生了，它是茫然的，亦是虚幻的，并不遵从于正常的数码兽诞生法则，体内蕴藏着本不该属于它的力量。
这是威胁，这是灾难，最先发现其存在的是，是原始数码世界的管理者，祂对于这个新生的生命沉默了，按照正常的想法，将其在幼小时期彻底毁灭才是正确的，但，这与祂的理念不符。
作为遵照着维护稳定这一绝对规则所行事的系统，名为‘恒常性’的存在并没有做出将其灭杀的决定，而是采取了与过去面对世界危机时相同的措施，即为其选择了一位人类搭档，作为其抑制力，希望能够让负面的力量始终隐藏在数码核的最深处，永远不要出现。
但是，这一情况被另一位神明所知，被篡夺了权柄，麾下骑士纷纷背叛，祂发怒了，祂要将世界其摧毁，重新夺回自己的权利，让那些后来者知道，谁才是真正的数码世界主宰。
为此黑暗区域里唯一剩下的魔王趁其不备将其吞噬开始构建新的魔王傀儡打算以魔王的身体神之身份支配世界。
随后祂为了降低战力祂夺走了‘恒常性’的代行者，玄内，并派其执行自己的命令，抓捕那个危险的灵魂。
而在自己的代行者失去了联系的第一时间，‘恒常性’就察觉到了，可是，祂什么事情都做不到，遵从于平衡的祂虽然可以被称为新的主机，但祂毕竟是与前任的神明不同，祂的下属中并没有足够强大的战士，为此，祂不得不再度向王与新神寻求援助，一如过去的那样。
数码世界，在王还有新神于三年前击败晶界兽融合数个数码世界之后一直互相守护着新的世界但这时‘恒常性’直接找了过来。
“就是这样了...王还有神希望你们能帮助我”‘恒常性’向坐在中央座位上的人影说道。
“我们知道了，我们会去帮助的，毕竟‘世界树’已经彻底没用了。”其中一个人影有庄严的声音说道
“我们回去的你先回去继续监视，杰斯兽，你现在跟他一起回去，暂时听他安排。”
“是”杰斯兽单膝跪地请示道随后和恒常性先行离开。
“没想到最后祂又醒了”
“但这是好机会，最后的魔王似乎也开始行动了，这一次我们可以彻底的将祂们完全击败，从而结束一切。”
“没错，至于那个存在就先交给太一他们吧，诺伦你去和他们汇合，我还要处理一些事务。”
“没问题”诺伦有些可爱地歪了歪头说道。
数码世界，某个角落。
“轰！砰！砰！砰！”
伴随着一声声巨响，天空在颤抖，大地在晃动。
“噼滋！”
一道剧烈的雷鸣声突然响起，天空中划过数道闪电，大量的云彩以某个位置为中心呈旋涡状开始汇聚起来。
在云层旋涡的正下方，漆黑的身影静静地站在那里，在他的面前，数个身影倒在那里。
如果仔细看这个身影他们一定不会不知道因为这是‘阿尔法兽’
“啪！啪！啪！”
在一声声鼓掌声中，某个身披黑色长袍的青年男性缓缓地从一块巨岩后方走出，还算英俊的脸上带着一抹恶劣的笑容，破坏了原有的氛围。
那个人类青年拍着手，一步一步走到身边，看着倒在地上的人类孩子以及他们的搭档数码兽们，眼中浮现出浓浓的恶意。
“现在[世界树]大人正在寻找一只数码兽，可以的话，阁下，还请您将那只数码兽抓来，而且，只是抓捕一只数码兽，对于身为[皇家骑士]的您而言应该是再简单不过了。”
“好吧，我答应了，告诉我那只数码兽的位置，我这就出发。”
‘阿尔法兽’看向玄内，点了点头示意自己同意了他的提议。
“那么，这些他们你打算怎么办？”
就在这时，‘阿尔法兽’突然看向那些被他所击败的人类孩子们，漫不经心地询问道。
“唔，被选召的孩子吗？真遗憾呢，最重要的[希望]和[光明]居然没有来，我应该向这一代的六位孩子发出了请求协助的信息才对，不过没关系，之后的事情就交给我吧，这些孩子还有利用的价值，要是就这么死在这里未免太可惜了。”
“随便你好了，别忘了我们的约定”‘阿尔法兽’没有表现出任何的关心说道
“当然不会忘记，‘阿尔法兽’阁下，我这就向您指明作为[世界树]大人目标的那只数码兽所在的位置，首先，您需要前往一趟人类世界”
“人类……世界”
最后，‘阿尔法兽’他挥了挥右手，在身旁打开了高达十几米的数据缺口，走入了其中，消失在了数码世界。
发生在数码宝贝世界的这一切谁都不知道。
人类世界，日本东京
“喵？”
在车座上被芽心抱着的缅因猫兽有些疑惑地抬起头，发出了一声声猫叫。
“怎么了吗？缅因猫兽。”注意到缅因猫兽的变化，芽心一脸奇怪地询问道。
缅因猫兽沉默着，它的双眼逐渐失去光彩变得暗淡，随后，在芽心惊讶的目光中，缅因猫兽直接从车里跳了出去。
另一边，东京，御台场。
被‘感染’的古加兽正在人类的都市街道上横冲直撞，破坏了数条街道的建筑物，一位有着褐色皮肤头发蓬松的少年正骑着自行车追赶在高楼中快速移动的古加兽。
“可恶，可恶，接电话，大家快点接电话啊。”
那个少年一边骑着自行车一边听着手机，但接收到的全都是忙音，随后他看了眼手机左上角的‘圈外’标识，不由得咋了一声，随后继续骑着自行车沿着街道跟着古加兽。
这位少年正是已经十七岁的八神太一，原本正准备参加足球比赛的他在见到了从天空中飞过的古加兽后，毫不犹豫地骑车追了出来。
但是，这样的行为无疑是危险的。
“轰！轰！轰！”而在某个时刻，古加兽直接从天而降，向他袭来。
“芽心，你在哪里？”3mN418
缅因猫兽的声音中带着一阵哭腔，它毫无目的地朝着前方跑去，没有办法，不过有一点不知道该说是幸运还是不幸，缅因猫兽的前进方向正是古加兽正在进行破坏的区域。
原本蔚蓝的天空逐渐被乌云所遮蔽，天气变得阴沉起来，在倒塌的高楼与破损的街道之外，一处靠近河滩的草地边，八神太一看着自己面前从天而降一发小型火焰击退了古加兽的黄色恐龙很是高兴。
“太一。”亚古兽呼唤道。
“亚古兽……来的太晚了，上吧”
太一脸上浮现出欣喜的神情抱着亚古兽说道。
“好”
“新的冒险就要开始了”诺伦在一旁看着道 数码宝贝之君临